Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phf12Q5SPL2 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf12Q5SPL2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf12Q5SPL2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf12Q5SPL2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf12Q5SPL2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf12Q5SPL2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf12Q5SPL2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf12Q5SPL2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phf12Q5SPL2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phf12Q5SPL2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms