Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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