Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn34b4Q3V0X2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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