Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm7609-203ENSMUST00000160058 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrc43Q3V0L5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms