Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms