Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Skap2Q3UND0 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms