Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Arfgef3Q3UGY8 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms