Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hectd3Q3U487 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd3Q3U487 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms