Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sec24aQ3U2P1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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