Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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