Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ccndbp1Q3TVC7 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccndbp1Q3TVC7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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