Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc13Q3TIR1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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