Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Jmjd8Q3TA59 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms