Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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