Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Treml4Q3LRV9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms