Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ttc39dQ0VF76 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms