Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Siah1bQ06985 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms