Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms