Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SmsP97355 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SmsP97355 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SmsP97355 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SmsP97355 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SmsP97355 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms