Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cbx1P83917 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms