Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gbx1P82976 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gbx1P82976 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx1P82976 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms