Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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