Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Acta1P68134 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Acta1P68134 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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