Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ClgnP52194 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClgnP52194 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClgnP52194 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClgnP52194 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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