Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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