Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtpreP49446 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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