Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SrprbP47758 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrprbP47758 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrprbP47758 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrprbP47758 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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