Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
TtlP38585 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
TtlP38585 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms