Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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