Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PtprmP28828 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprmP28828 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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