Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxraP28700 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxraP28700 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxraP28700 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxraP28700 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxraP28700 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxraP28700 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxraP28700 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxraP28700 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxraP28700 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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