Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl3P27659 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms