Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrkchP23298 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms