Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clk1P22518 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Clk1P22518 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clk1P22518 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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