Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Prim1P20664 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Prim1P20664 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Prim1P20664 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim1P20664 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms