Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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NelfeP19426 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms