Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P18533 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P18533 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P18533 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms