Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
P18530 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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P18530 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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P18530 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
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P18530 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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P18530 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
P18530 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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