Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms