Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Myod1P10085 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms