Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
HbaP01942 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HbaP01942 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HbaP01942 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HbaP01942 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
HbaP01942 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
HbaP01942 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HbaP01942 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms