Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ifnb1P01575 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ifnb1P01575 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ifnb1P01575 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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