Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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