Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DffaO54786 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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