Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm2888K7N746 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms