Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm8888J3QPX5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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