Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms