Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Gm28048F7BCN0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Gm28048F7BCN0 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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