Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Srp54bE9PXC0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms