Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms